中醫是自然科學的一部分，與易經有著密不可分的關係。黃帝內經，是現存最早的中醫理論著作，對後世中醫學理論的奠定有極深遠的影響，而內經中的重要基礎理論，就是源自於易經。

一、易經與中醫陰陽學說

中醫著作黃帝內經，受易經的影響很大。黃帝內經書中的的陰陽學說，就是來自於易經。陰陽學說是中國傳統文化的一種觀念。

二、易經與中醫人體科學

易經影響了中醫的哲學觀「氣一元論」的建立，氣一元論認為，氣的運動跟五臟六腑的活動有所關聯，人體內的氣是一種活力很強的物質，全身無處不到，人體的生命活動基本上就是氣的活動，氣活動一旦停止，生命活動也會跟著停止。而易經中常用人體器官描述卦象，例如乾為首、兌為口、離為目、震為足、巽為股、坎為耳、艮為手、坤為腹。

另外，人身上有12個經絡，每個經絡都能配合八卦，利用這種相關性，開出正確的處方可以達到更快速的治療。而12經絡中的肺經配卦是巽、大腸經配卦是震、胃經配卦是坎、脾經配卦是離、心經配卦是兌、小腸經配卦是艮、膀胱經和膽經配卦是乾、腎經和肝經配卦則是坤卦。

三、易經與中醫五行

中醫藥體系為什麼不用八卦而用五行，是因為五行是八卦的濃縮。八卦的乾兌是金、艮坤是土、震巽是木，離為火，坎為水。

五行是陰陽的演化，中醫學把疾病的相關性放在了五行上，由於五行的類屬不同，導致了眾多疾病的發生。例如:風寒暑溼燥火，是天地五行所導致，七情是五臟內五行所化。所以，疾病的因素再複雜，它也離不開這個五行。反過來說，中醫治療疾病也是利用五行。

四、結論

中醫理論強調「天人合一、陰陽五行」的原理。所謂天人合一，即天為大宇宙，而人為小宇宙，人的行為符合大自然的規律，則萬事順，百病不生。人體為一整體，各內在器官息息相關，其中若有一者陰陽失調，運行不暢，皆會影響全局。因此可見中醫源遠流長，醫與易是密不可分的。